83年-89年

    • 83年10月創校，成立醫學系、醫學技術學系、公共衛生學系、護理研究所
    • 84年 8月 設立醫學研究所
    • 86年 8月 設立護理學系
    • 87年 8月 設立原住民健康所、藥理暨毒理學研究所
    • 87年 8月 「慈濟醫學院」更名「慈濟醫學暨人文社會學院」
    • 89年 8月 「慈濟醫學院」升格「慈濟大學」(含醫學院、人文社會學院、生命科學院、教育傳播學院)

90年-99年

    • 90年 8月 設立醫學研究所博士班
    • 91年 8月 設立醫學資訊學系
    • 92年 8月 設立醫學技術學系碩士班、公共衛生學系碩士班
    • 93年 8月 設立醫學資訊學系碩士班
    • 93年 8月 設立微生物學、免疫學暨生物化學研究所
    • 94年 8月 設立生理暨解剖醫學研究所碩士班
    • 96年 8月 設立臨床醫學研究所博士班(99年8月更名為醫學科學研究所)
    • 98年 8月 設立物理治療學系 98年 8月 設立生理暨解剖醫學研究所碩士班
    • 99年 8月 設立微生物學、免疫學暨生物化學研究所碩士班
    • 99年 8月 設立醫學科學研究所博士班(醫學研究所博士班與臨床醫學研究所博士班合併成立，下設基礎醫學組、臨床醫學組及健康科學組)

100年~

    • 101年 5月 醫學系通過台灣醫學院評鑑委員會(TMAC)的評鑑
    • 101年 8月 設立學士後中醫學系
    • 103年 2月 與中研院簽訂轉譯醫學博士學位學程合作
    • 103年 5月 衛生福利部健康資料加值應用協作中心慈濟大學研究分中心揭牌
    • 103年 8月 設立微生物及免疫學碩士班、生物化學碩士班(原微生物學、免疫學暨生物化學研究所分班)
    • 104年 5月 醫學系通過台灣醫學院評鑑委員會(TMAC)103年度追蹤訪視評鑑。
    • 104年 5月 原「健康資料加值應用協作中心」更名為「衛生福利資料統計應用中心」
    • 104年 5月 慈濟大學中草藥園開幕
    • 104年 8月 設立物理治療學系碩士班
    • 107年11月 新加坡國立大學教授來訪
    • 107年12月 Insilico台灣分公司執行長-康亞圖蒞校演講
    • 108年 1月 中研院副院長蒞臨慈大進行學術交流
    • 108年 6月 楊仁宏院長榮獲第16屆國立陽明大學服務類傑出校友
    • 109年11月 2020第三屆慈濟-中央研究院國際生物醫學科學研討
      會
    • 110年10月校院合和互協 2021慈濟醫學教育日於慈大登場
    • 110年11月慈科大32週年校慶與慈大、中央大學簽MOU
    • 111年12月慈大舉辦第五屆慈濟中研院生物醫學科學研討會
    • 112年10月全國醫學院盃球類聯誼賽
    • 113學年 設立藥學系、口腔醫學暨材料研究所
    • 113年 8月 慈濟大學與慈濟科技大學合併
    • 113年 8月 醫學影像暨放射科學系加入醫學院